L'IFSM è membro dal 1976.
La Federazione Internazionale delle Società per la Microscopia è stata creata dall'ICSU nel 1951 come Commissione Congiunta per la Microscopia Elettronica. Divenne una federazione indipendente, con lo scopo di promuovere la cooperazione internazionale tra microscopisti, nel 1955. La federazione ha tre Comitati Regionali, 38 Società Membro nazionali e 6 Società Membro Associate nazionali.