L'Accademia ceca delle scienze è membro dal 1922.
L'Accademia delle Scienze della Repubblica Ceca è una delle organizzazioni successore dell'Accademia delle Scienze cecoslovacca, che rappresentava la Cecoslovacchia nell'ISC dal 1952. In precedenza, la Cecoslovacchia era rappresentata dal Consiglio Nazionale delle Ricerche Cecoslovacco. L'Accademia delle Scienze funziona come un'associazione di 54 istituti di ricerca nei campi delle scienze naturali e tecniche, delle scienze sociali e umanistiche. È responsabile del funzionamento di 36 comitati nazionali e rappresenta la Repubblica Ceca nell'ISC, nei suoi comitati e nelle unioni scientifiche. I comitati nazionali sono composti da rappresentanti delle università e degli istituti di ricerca della Repubblica ceca. Nel gennaio 2015 ha cambiato nome in Accademia ceca delle scienze.